通过分子对接和网络药理学方法揭示胶质母细胞瘤中柚皮苷的抗癌机制。
摘要来源：Sci Rep. 2024 Sep 14 ;14( 1）：21486。 Epub 2024 年 9 月 14 日。PMID：39277626
摘要作者：Arunraj Tharamelveliyil Rajendran、Gupta Dheeraj Rajesh、Harsha Ashtekar、Anusha Sairam、Pankaj Kumar、Anoop Narayanan Vadakkepushpakath
文章归属：Arunraj Tharamelveliyil Rajendran
摘要：柚皮苷是一种黄酮类化合物，具有多种治疗特性，并已被证明对癌细胞具有细胞毒作用。然而，柚皮苷维持其对胶质母细胞瘤（GBM）细胞毒作用的确切机制仍不清楚。因此，当前的研究旨在建立提出了柚皮苷抑制 GBM 的合理细胞机制。我们采用各种系统生物学技术来预测主要目标，包括基因本体和聚类分析、KEGG富集路径估计、分子对接、MD（分子动力学）模拟和MMPBSA分析。胶质母细胞瘤靶序列通过 DisGeNet 和治疗靶标预测获得，与柚皮苷靶标进行比对，并进行基因富集和本体分析。基因富集分析确定了前十个中心基因。此外，对所有已识别的目标进行了分子对接。对于分子动力学建模，我们选择了表现出最大对接亲和力的两个复合物以及通过基因富集分析确定的中心的两个最突出的基因。研究发现 PARP1 和 ALB1 信号通路是主要的调控途径。柚皮苷与 PARP1 (4ZZZ) 的结合潜力最高，为 - 12.90 kcal/mol，其次是 ABL1 (2ABL)），通过分子对接测定，柚皮苷显示出 - 8.4 kcal/mol 结合分数。分子动力学方法、MM-PBSA 研究以及 PCA 研究表明，与伊马替尼和他拉佐帕尼相比，柚皮苷与 4ZZZ (PARP1) 和 2ABL (ABL1) 的复合物高度稳定。信号通路分析表明柚皮苷可能通过影响蛋白质 PARP 和 ALB1 水平而具有抗 GBM 的抗癌作用。对两种不同的胶质母细胞瘤细胞系 C6 和 U87MG 细胞进行细胞毒性测定。与 C6 大鼠胶质瘤细胞相比，柚皮苷对 U87MG 人胶质母细胞瘤细胞具有更高的细胞毒性。