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基于计算机蛋白水解和虚拟筛选从薏仁中发现抗高血压寡肽。
摘要来源：Int J Mol Sci。 2016 年 12 月 14 日；17(12)。 Epub 2016 年 12 月 14 日。PMID：27983650
摘要作者：乔连胜、李斌、陈艳坤、李玲玲、陈曦、王灵芝、卢芳、罗刚刚、李功宇、张艳玲
文章所属单位：乔连胜
摘要：薏米是常用的中药，种子贮藏蛋白含量较高。薏仁水解生物活性寡肽已被证明是抗高血压的有效成分。然而，薏米生物活性寡肽的结构和抗高血压机制尚不清楚。耳朵。为了从薏仁中发现明确的抗高血压寡肽，通过计算机蛋白水解和虚拟筛选获得了潜在的寡肽，并通过生化测定和分子动力学模拟进一步鉴定。本文收集了 10 条薏米谷醇溶蛋白序列，并进行计算机水解，构建了含有 134 条寡肽的寡肽文库。该文库是通过我们课题组构建的抗高血压药效团数据库进行反向筛选的，包含10个抗高血压靶点。血管紧张素-I 转换酶 (ACE) 被确定为薏仁寡肽抗高血压活性的主要潜在靶点。利用ACE的三种晶体结构进行对接研究，最终鉴定出19种具有潜在ACE抑制活性的寡肽。根据药效团和对接图谱特征及评价指标，筛选出3种寡肽进行生化分析化验。通过反相高效液相色谱 (RP-HPLC) 测定，寡肽序列 NPATY (IC= 61.88± 2.77 µM) 被鉴定为 ACE 抑制剂。 NPATY 的分子动力学模拟进一步用于分析相互作用键和关键残基。 ALA354 被确定为 ACE 抑制剂的关键残留物。 VAL518的疏水效应和HIS383、HIS387、HIS513和Zn的静电效应也被认为在抑制ACE活性中发挥着关键作用。本研究为基于计算机蛋白水解和虚拟筛选的中药蛋白药理机制探索提供了研究策略，有利于揭示中药蛋白的药理作用，为多肽类药物提供新的先导化合物。设计。