慢性低度炎症的 DNA 甲基化特征与复杂疾病相关。
摘要来源:基因组生物学。 2016 年 12 月 12 日;17(1):255。 Epub 2016 年 12 月 12 日。PMID:27955697
摘要作者:Symen Ligthart、Carola Marzi、Stella Aslibekyan、Michael M Mendelson、Karen N Conneely、Toshiko Tanaka、Elena Colicino
文章隶属关系:Symen Ligthart
摘要:背景:慢性低度炎症反映了与复杂疾病发病机制有关的亚临床免疫反应。识别 DNA 甲基化与慢性低度炎症相关的基因位点可能会揭示炎症的新途径或治疗靶点
结果:我们对血清 C 反应性的表观基因组范围关联研究 (EWAS) 进行了荟萃分析蛋白质(CRP)是大量欧洲人群(n = 8863)中低度炎症的敏感标志物,以及非裔美国人(n = 4111)中的跨种族复制。我们在欧洲血统的发现小组中发现 218 个 CpG 位点的差异甲基化与 CRP 相关 (P < 1.15 × 10(-7)),并重复 (P < 2.29 × 10(-4)) 58 个 CpG 位点(45 个独特的位点)在非裔美国人中。为了进一步表征研究结果的分子和临床相关性,我们检查了与基因表达、基因序列变异和临床结果的关联。 9 个 (16%) CpG 位点的 DNA 甲基化与顺式全血基因表达相关 (P < 8.47 × 10(-5)),10 个 (17%) CpG 位点与附近的遗传变异相关 (P < 2.50 × 10) (-3)) 和 51 (88%) 也与至少第一个相关的心脏代谢实体(P < 9.58 × 10(-5))。复制 CpG 位点的加性加权评分可解释高达 6% 的年龄调整和性别调整 CRP 个体间变异 (R2),与已知的 CRP 相关遗传变异无关。
结论:我们已经完成了慢性低度炎症的 EWAS,并确定了许多潜在炎症的新遗传位点,这些位点可以作为开发新型治疗干预措施的目标炎症。