利用 SARS-CoV-2 主要蛋白酶作为靶标，从印度香料中鉴定新型抗 nCoV 药物化合物。
摘要来源：J Biomol 结构动态。 2020 年 5 月 2:1-9。 Epub 2020 年 5 月 2 日。PMID：32362243
摘要作者：Umesh、Debanjan Kundu、Chandrabose Selvaraj、Sanjeev Kumar Singh、Vikash Kumar Dubey
文章隶属关系：Umesh
摘要：2019 年- 新型冠状病毒 (nCoV) 在人群中引发冠状病毒病 19 (COVID-19) 大流行，从而引发全球健康危机。由于缺乏针对 nCoV 的特异性疫苗和抗病毒药物，科学需要在针对 COVID-19 的药物设计和发现领域做出真诚的努力。新型冠状病毒主要蛋白酶（SARS-CoV-2 Mpro）在疾病传播过程中发挥着至关重要的作用，因此 SARS-CoV-2 Mpro 代表了药物发现的药物靶标。在此，我们应用生物信息学方法从印度香料中筛选化合物作为 SARS-CoV-2 主要蛋白酶的有效抑制剂（PDBID：6Y84）。印度香料化合物的结构文件取自PubChem数据库或Zinc数据库，并使用AutoDock-4.2、MGLTools-1.5.6、Raccoon虚拟筛选工具进行分子对接筛选。分析了基于最高结合亲和力的前 04 个命中。鼠尾草酚表现出最高的结合亲和力-8.2 Kcal/mol，并与 SARS-CoV-2 Mpro 活性位点上的氨基酸残基具有强烈而稳定的相互作用。 Arjunglucoside-I (-7.88 Kcal/mol) 和 Rosmanol (-7.99 Kcal/mol) 也表现出强大而稳定的结合亲和力以及良好的 ADME 特性。这些化合物在 50 纳秒的 MD 模拟中显示出与蛋白质作用的强氢键相互作用ive 位点并在活性位点内保持稳定。我们的虚拟筛选结果表明，这些小化学分子可用作 SARS-CoV-2 Mpro 的潜在抑制剂，并可能对 nCoV 具有抗病毒作用。然而，这些针对 SARS-CoV-2 主要蛋白酶的抑制剂需要进一步验证和研究，才能获得临床试验的候选资格。