通过基于结构的虚拟筛选和分子动力学研究，从10种重要香料中鉴定出SARS-CoV-2主要蛋白酶和刺突受体的潜在抑制剂。
摘要来源：J Biomol Struct Dyn。 2020 年 9 月 18:1-22。 Epub 2020 年 9 月 18 日。PMID：32948116
摘要作者：Debanjan Sen、Pradip Debnath、Bimal Debnath、Samhita Bhaumik、Sudhan Debnath
文章隶属关系：Debanjan Sen
摘要：疫情由 SARS-CoV-2 引起的新型冠状病毒病（COVID-19）对人类健康和世界经济活动构成严重威胁。目前尚无治疗 COVID-19 患者的特效药物。传统上，人们一直使用生姜、胡芦巴等香料离子等用于治疗普通感冒。这项工作从 10 种现成的香料中鉴定出 SARS-CoV-2 主要蛋白酶 (M) 和刺突 (S) 受体的潜在抑制剂。 S和M这两种蛋白分别在病毒进入宿主细胞以及病毒的复制和转录过程中发挥重要作用。为了识别潜在的分子，我们根据所选香料建立了包含 1040 种化合物的内部数据库。使用 Glide 对两种重要的 SARS-CoV-2 蛋白进行了该数据库基于结构的虚拟筛选。使用 AutoDock 4.2 和 AutoDock Vina 对虚拟筛选 (VS) 产生的热门命中进行分子对接，以消除误报。使用 GROMACS 对针对 Man 的前 6 个命中和针对尖峰受体的前 5 个命中进行 130 ns 分子动力学模拟。最后，化合物---和-M复合物，以及化合物-,-,-,和-刺突受体复合物在整个模拟过程中表现出稳定性。时间。 ADME 值还支持所选命中的药物样性质。这九种化合物存在于洋葱、大蒜、生姜、薄荷、辣椒和胡芦巴中。所有香料都是可食用的，经过适当的生物学评估后，可以用作对抗 COVID-19 的家庭疗法。