通过分子对接和分子动力学模拟，番茄碱和广藿香醇作为 SARS-CoV-2 酶（3CLpro、PLpro 和 NSP15）的抑制剂。
摘要来源：国际分子科学杂志。 2021 年 10 月 2 日；22(19)。 Epub 2021 年 10 月 2 日。PMID：34639036
摘要作者：Rafat Zrieq、Iqrar Ahmad、Mejdi Snoussi、Emira Noumi、Marcello Iriti、Fahad D Algahtani、Harun Patel、Mohd Saeed、Munazzah Tasleem、Shadi Sulaiman、Kaïss Aouadi、Adel Kadri
文章隶属关系：Rafat Zrieq
摘要：考虑到当前由于 SARS-CoV-2 感染的广泛传播而造成的严重和致命的情况，迫切需要确定新的未满足的医疗需求预防和治疗冠状病毒病的有效方法（COVID 19）通过重新评估和重新利用已知药物。为此，番茄碱和广藿香醇已被选为对抗病毒的潜在药物。随后将命中的化合物对接到活性位点，分子对接分析表明，这两种药物都可以结合 SARS-CoV-2 3CLpro、PLpro、NSP15、COX-2 和 PLA2 靶标的活性位点，并具有许多重要的结合相互作用。为了进一步验证有前景的化合物番茄碱的相互作用，对3CLpro、NSP15和COX-2进行了100 ns的分子动力学研究。这表明蛋白质-配体复合物在整个模拟期间保持稳定，并且系统中发生了最小的主链波动。分子动力学数据的动态 MM-GBSA 分析表明，平均结合自由能分别为 47.4633±9.28、51.8064±8.91 和 54.8918±7.55 kcal/mol。同样，所选配体的计算机 ADMET 研究显示出优异的药代动力学特性具有良好的吸收性、生物利用度、无毒性。因此，广藿香醇，尤其是番茄碱，可能通过潜在抑制病毒复制，为对抗 SARS-CoV-2 感染提供前景的治疗选择，尽管更多的研究有保证和安全。