通过网络药理学抑制炎症反应的生物活性化合物和信号通路。
摘要来源:Life(巴塞尔)。 2023 年 3 月 27 日;13(4)。 Epub 2023 年 3 月 27 日。PMID:37109422
摘要作者:Juri Jin、Md Helal Uddin Chowdhury、Md Hafizur Rahman、Ki-Young Choi、Md Adnan
文章隶属关系:Juri Jin
摘要:(WE) 是一种药用蘑菇,也是天然抗炎物质的极好来源。然而,具体的生物活性化合物和抗炎症作用机制尚未确定。在这里,我们通过网络药理学研究了抗炎生物活性化合物及其分子机制。 WE (MEWE) w 的甲醇 (ME) 提取物用于 GC-MS 分析以鉴定生物活性物质,并按照 Lipinskis 规则进行筛选。使用公共数据库提取选定的生物活性物质和炎症相关目标,维恩图揭示了共同目标。然后,使用 STRING 和 Cytoscape 工具构建蛋白质-蛋白质(PPI)网络和蘑菇-生物活性物-靶标(M-C-T)网络。通过访问DAVID数据库进行基因本体和KEGG通路分析,并进行分子对接来验证结果。通过计算量子力学建模方法(DFT研究)探索关键化合物和标准药物的化学反应性。 GC-MS 结果显示有 27 种生物活性物质,并且全部遵循 Lipinskis 规则。公共数据库发现了 284 个化合物相关靶点和 7283 个炎症靶点。维恩图指出了 PPI 和 M-C-T 网络中体现的 42 个共同目标。 KEGG 分析指出了 HIF-1 信号通路,因此,我们建议预防炎症反应发生的策略是抑制下游 NFKB、MAPK、mTOR 和 PI3K-Akt 信号级联。分子对接揭示了“N-(3-氯苯基)萘甲酰胺"对与 HIF-1 信号通路相关的五种靶蛋白的最强结合亲和力。与 DFT(密度泛函理论)分析中使用的标准药物相比,所提出的生物活性物质显示出良好的电子供体成分和降低的化学硬度能。我们的研究明确了 MEWE 的治疗效率,这项工作提出了一种关键的生物活性化合物及其抗炎症的作用机制。