丁子香酚和阿魏酸作为转录调节因子 RhlR 的竞争性抑制剂的作用。
摘要来源：MethodsX。 2022 年；9：101771。 Epub 2022 年 6 月 23 日。PMID：35800985
摘要作者：Esmeralda Escobar-Muciño
文章归属：Esmeralda Escobar-Muciño
摘要：搜索群体感应 (QS) 抑制剂具有挑战性由于广泛的抗生素耐药性而寻找治疗方法。因此，本研究旨在探讨十种芳香族化合物作为 QS 中三种转录调节因子的抑制剂。该方法包括使用软件 Chimera（工具 vina）和 Mcule 确定结合吉布斯能量（BGE），并通过 Tukey 方法比较平均值（ p≤0.05) 寻找抑制剂的QS。随后，通过三个QSAR模型评估小鼠模型中的LD，并从ADME（吸收分布代谢排泄）和PubChem数据库中获得药代动力学值。发现了三种潜在的 RhlR 抑制剂，其 BGE 值较低，范围为 -6.70±0.21 至 -7.43±0.35 kcal/mol。另一方面，所有化合物对于 Lipinskis 五法则和理论小鼠 LD 和 ADME 值都是可接受的。结论是，阿魏酸和丁子香酚表现出最佳的总BGE值（-75.07±0.892和-70.36±1.022 kcal/mol），建议将它们作为对抗毒力的新疗法。最后，这些研究已证明对于推定的 QS 抑制剂预测和从本研究中获得的结果获得新的研究衍生品而言是可重复的和有价值的。• 该方法的主要优点是： 使用免费、许可、灵活且高效的软件分子对接。 • 使用两种分子对接软件对 BGE 进行验证和比较存在于三种不同的蛋白质中。 • 使用经典分子动力学来定义相互作用蛋白-配体的稳定性和总 BGE，并找到最佳的蛋白抑制剂，以建议它们作为针对特定病原体毒力的可能疗法。