从 C57BL/6J 小鼠基因组中鉴定一组小白鼠内源性病毒样内源性逆转录病毒：原病毒基因组、毒株分布、表达特征和基因组整合谱。
摘要来源：染色体研究。 2012 年 11 月 30 日。Epub 2012 年 11 月 30 日。PMID：23197326
摘要作者：Kang-Hoon Lee、Ri-Na You、David G Greenhalgh、Kiho Cho
文章所属单位：加州大学戴维斯分校外科系北加州儿童医院，2425 Stockton Blvd., Sacramento, CA, 95817, USA。
摘要：关于小鼠基因组的 10% 被与内源逆转录病毒 (ERV) 相关的序列占据。然而，小鼠 ERV 和相关元件的全面概况尚未建立。在这项研究中，我们从小鼠基因组中鉴定了一组 ERV，并对其进行了表征。它们的生物学特性。使用定制的 ERV 挖掘协议，将 191 个 ERV（之前报道的 159 个位点和 32 个新位点）（暂定名为 Mus dunni 内源病毒 (MDEV) 样 ERV (MDL-ERV)）映射到 C57BL/6J 小鼠基因组上。其中七个保留了三种逆转录病毒多肽（gag、pol 和 env）的假定完整编码潜力。在检查的 57 种小鼠品系中，除了 Mus pahari/Ei 品系外，所有品系都具有与保守的 MDL-ERV 区域相对应的 PCR 扩增子。有趣的是，Mus caroli/EiJs 扩增子比其他扩增子稍大，这与 M. caroli/EiJ 和 C57BL/6J 菌株的 MDL-ERV 群体之间的相当大的系统发育距离相一致。与大脑、心脏、肾脏和肝脏相比，MDL-ERV 在 C57BL/6J 小鼠的肺、脾和胸腺中高表达。七个 MDL-ERV 被定位在六个注释基因的内含子中。有趣的是，一些 MDL-ERV 定期映射到 X 染色体的三个簇上。发现这些 MDL-ERV形成串联阵列的镶嵌重复单元的几种类型的逆向元件之一表明，镶嵌重复单元的形成先于串联排列事件。需要进一步的研究来了解 MDL-ERV 在正常和病理条件下的生物学作用。