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患有严重肺部疾病的囊性纤维化患者气道中的不同微生物组基因库。
摘要来源：国际分子科学杂志。 2017 年 7 月 29 日；18(8)。 Epub 2017 年 7 月 29 日。PMID：28758937
摘要作者：Giovanni Bacci、Alessio Menoni、Ersilia Fiscarelli、Nicola Segata、Giovanni Taccetti、Daniela Dolce、Patrizia Paganin、Patrizia Morelli、Vanessa Tuccio、Alessandra De Alessandri、Vincenzina Lucidi、Annamaria Bevivino
文章归属：Giovanni Bacci
摘要：近年来，下一代测序（NGS）被用来破译结构和组成囊性纤维化（CF）患者气道微生物群。然而，对于基因的整体功能仍然知之甚少。由常驻微生物种群确定哪些特定基因与 CF 肺病的各个阶段相关。在本研究中，我们的目的是通过痰鸟枪法宏基因组测序来鉴定 12 名患有严重和正常/轻度肺病的患者的 CF 微生物群的微生物基因库。由宏基因组重建了 CF 气道中微生物编码的丰富代谢途径。我们确定了一组在不同肺功能患者中分布不同的代谢途径；即与细菌趋化性和鞭毛组装相关的途径，以及编码外排介导的抗生素抗性机制和毒力相关基因的基因。结果表明，肺功能低下的 CF 患者的微生物组富含毒力相关基因和编码外排介导的抗生素耐药机制的基因。总体而言，患有 CF 的严重受影响成年人的微生物群似乎有所增加阐述了促进微生物在肺部定植和持久存在的不同机制，这与严重肺部疾病患者中常见的多重耐药微生物群落的特征一致。