基于分子对接筛选印楝衍生化合物与流感病毒 NS1 蛋白。
摘要来源：生物信息。 2015；11(7):359-65。 Epub 2015 年 7 月 31 日。PMID：26339153
摘要作者：Aftab Ahmad、Ammara Ahad、Abdul Qayyum Rao、Tayyab Husnain
文章所属：Aftab Ahmad
摘要：未标记：不同毒株的流感病毒正在影响全世界有大量的人在与流感病毒作斗争，市场上有许多针对流感病毒的合成抗病毒药物。但仍然需要开发针对所有流感病毒株的药物。对于这个普通过比对国家生物技术信息中心 (NCBI) 蛋白质数据库中现有毒株的所有可用序列，发现了流感病毒 NS1 蛋白质中的保守残基。印楝（Azadirachta indica）叶提取物中的化合物以前已知具有抗病毒特性，现在经过虚拟筛选，以确定无副作用的天然药物。分子对接鉴定了八种潜在化合物（Tetratriacontane、127-40-2、6-o-ACETYLNIMBADIOL、芦丁、Tiplasinin、金丝桃苷、( )- Nimocinolide 和 Quercitrin），发现与报道的保守残基（R19、R35、S42 和D39)流感病毒NS1蛋白参与药物结合。进一步分析发现，6-o-乙酰基尼班二醇、芦丁和替普拉西宁可作为抗流感病毒株的药物，因为它们的结合残基在所有病毒株中都是保守的。这项研究最好地强调了印楝化学物质对抗流感病毒的潜力，并且它p为进一步考虑这些产品进行体内和体外验证提供了方向。
缩写：NS1 蛋白 - 非结构 1 蛋白，NA - 神经氨酸酶，HA - 血凝素，M - 小肠结肠炎耶尔森氏菌 8081，ypk -鼠疫耶尔森氏菌 KIM、yps - 假结核耶尔森氏菌 Db1、KEGG - 京都基因和基因组百科全书、KO - KEGG 正系学、KOBAS - 基于 KO 的注释系统。