通过计算机评估穿心莲内酯作为 NS3-4A 蛋白酶及其耐药突变体的有效抑制剂方法。
摘要来源：Adv Virol。 2015；2015：972067。 Epub 2015 年 10 月 26 日。PMID：26587022
摘要作者：Vivek Chandramohan、Anubhav Kaphle、Mamatha Chekuri、Sindhu Gangarudraiah、Gowrishankar Bychapur Siddaiah
文章隶属关系：Vivek Chandramohan
摘要：目前 PEG-INF 和利巴韦林联合疗法对抗丙型肝炎病毒 (HCV) 基因型 1 感染无效在 50% 的感染病例中保持持续的病毒反应。蛋白酶抑制剂形式的新化合物可以补充联合疗法。 Asunaprevir 是药物体系中的新药物nt作为NS3-4A蛋白酶抑制剂，但它容易受到两种突变的影响，即蛋白质中的R155K和D168A。因此，在我们的研究中，我们试图通过分子对接和动态模拟来评估穿心莲内酯（一种来自穿心莲植物的拉丹烷二萜类化合物）作为抑制 NS3-4A 蛋白酶及其伴随耐药突变体的有效化合物。我们的研究表明，与 Asunaprevir 与野生型 R155K 和 D168A 突变体的对接得分分别为 -3.7159、-2.6431 和 -5.4149 相比，穿心莲内酯的最佳对接得分分别为 -15.0862、-15.2322 和 -13.9072。此外，如 MD 模拟所示，该化合物能够很好地结合目标蛋白，并保持牢固的键合，对蛋白质主链结构造成的扰动非常小，甚至可以忽略不计。我们的结果验证了 Asunaprevir 对蛋白质变异的敏感性，如我们的对接研究和轨迹周期分析所示。因此，从我们的研究中，我们希望能够增加一重新选择药物方案来解决 HCV 感染的耐药性。