姜黄素与幽门螺杆菌毒力因子分子对接的见解。
摘要来源:生物信息。 2015;11(10):447-53。 Epub 2015 年 10 月 31 日。PMID:26664028
摘要作者:Akhileshwar Kumar Srivastava、Vikas Kumar、Bijoy Krishna Roy
文章归属:Akhileshwar Kumar Srivastava
摘要:幽门螺杆菌的毒性因子(Ureα/β、VacA-p55 和 CagA)结构域在发育过程中发挥着关键作用包括胃癌在内的多种疾病。姜黄素的药理学作用表明它可以通过与活性结构域相互作用来调节毒性因子的信号传导。然而,姜黄素相互作用的控制机制和有毒因子(Ureα/β、VacA-p55 和 CagA)结构基础上的结合多样性尚不清楚。姜黄素作为治疗剂通过Lipinski规则五和药物相似性进行筛选以评估药理特性。这里分子对接的结果呈现了姜黄素复合物的 3D 结构,该结构与目标结构域的特别保守的残基相互作用。该结构揭示了姜黄素与这些蛋白质结构域的络合提供了对蛋白质(Ureα/β、VacA-p55 和 CagA)识别的不同性质的结构洞察。计算机研究阐明,姜黄素的广泛特异性是通过多种结合模式机制实现的,例如涉及结合能的不同氢和疏水相互作用。姜黄素与两个亚基Ureα/β的络合分数越高,表明结合越稳定,而与分数越低的VacA-p55络合的稳定性越差。姜黄素表现出良好的相互作用尽管姜黄素与 Ureα/β 亚基的广泛相互作用可能对防止幽门螺杆菌在胃中的存活和定植具有重要意义,但姜黄素与这些有针对性的毒力因子的作用有关。