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全基因组测序揭示疫苗接种对百日咳博德特氏菌进化的影响。
摘要来源：Sci Rep. 2015 ；5: 12888。 Epub 2015 年 8 月 18 日。PMID：26283022
摘要作者：徐英华、刘斌、Kirsi Gröndahl-Yli-Hannuksila、谭雅君、陆峰、Teemu Kallonen、王立婵、彭鼎、何秋水、王雷、张淑敏
文章归属：徐英华
摘要：群体免疫可能会引起循环病毒的变化。然而，细菌病原体如何适应疫苗接种仍然很大程度上未知。本研究以百日咳的病原体百日咳博德特氏菌为例，探讨疫苗接种对该细菌病原体可能产生的影响。我们对来自芬兰和中国的 40 种百日咳博德特氏菌菌株以及来自荷兰的 11 种先前测序的菌株的完整基因组进行了测序和分析，荷兰在过去 50 年中使用了不同的疫苗接种策略。结果显示，这些国家和不同时期的分子钟移动速度不同，这表明百日咳博德特氏菌种群的进化与国家疫苗接种覆盖率密切相关。比较全基因组分析表明，这种人类限制性病原体的进化主要特征是持续的遗传转变和基因丢失。此外，在当前流行的含有 ptxP3 的菌株中专门检测到了 116 个 SNP。这一发现或许可以解释这一谱系的成功出现及其在世界范围内的传播。总的来说，我们的结果表明，疫苗接种的免疫压力是百日咳博德特氏菌进化的主要驱动力，这有助于进一步探索百日咳博德特氏菌的致病性。