对照受试者和腺瘤结直肠癌患者的人类肠道微生物群比较:末端限制性片段长度多态性和下一代测序分析。
摘要来源:Oncol Rep. 2015 年 11 月 4 日。Epub 2015 年 11 月 4 日。PMID:26549775
摘要作者:Chika Kasai、Kazushi Sugimoto、Isao Moritani、Junichiro Tanaka、Yumi Oya、Hidekazu Inoue、Masahiko Tameda、Katsuya Shiraki、Masaaki Ito、Yoshiyuki Takei、Kojiro Takase
文章隶属关系:Chika Kasai
摘要:结直肠癌 (CRC) 是日本癌症相关死亡的第三大原因。 CRC 的病因与多种因素有关,包括基因突变、饮食、生活方式、炎症以及最近的肠道微生物群。然而,与结直肠癌相关的肠道微生物群在很大程度上仍未得到研究。本研究使用末端限制性片段长度pol多态性(T-RFLP)和下一代测序(NGS)来分析和比较日本对照受试者和日本腺瘤癌患者的肠道微生物群。在结肠镜检查前立即从 49 名对照受试者、50 名结肠腺瘤患者和 9 名结直肠癌患者(3/9 为浸润性癌,6/9 为腺瘤内癌)采集粪便样本;从每个粪便样本中提取 DNA。根据 T-RFLP 分析,选择了 12 名受试者(6 名对照受试者和 6 名腺瘤癌受试者);他们的样本用于 NGS 和物种水平分析。 T-RFLP 分析显示对照组、腺瘤组和癌症组之间的细菌数量没有显着差异。然而,NGS 显示,i) 腺瘤受试者中的对照和癌受试者具有不同的肠道微生物群组成,ii) 一个细菌属(Slackia)与对照组和四个细菌属(放线菌属、Atopobium、梭杆菌属和嗜血杆菌属)显着相关与腺瘤组显着相关,并且 iii) 几种细菌种类与每种类型显着相关(对照:前列烷真杆菌;腺瘤中的癌:溶齿放线菌、脆性拟杆菌、梭状芽胞杆菌、变异梭杆菌、副流感嗜血杆菌、粪普氏菌、戈登链球菌和迪斯帕韦荣球菌)。日本人群中对照受试者和腺瘤患者的肠道微生物特性存在差异,这表明肠道微生物群与 CRC 的预防和发展相关。