香叶素作为前列腺癌有效化学预防剂的分析：分子对接、验证、动态模拟和基于药代动力学预测的研究。
摘要来源：J Biomol Struct Dyn。 2023 年 8 月 24:1-13。 Epub 2023 年 8 月 24 日。PMID：37615411
摘要作者：Sumit Sheoran、Swati Arora、Tanmayee Basu、Swati Negi、Naidu Subbarao、Anupam Kumar、Himanshu Singh、Dhamodharan Prabhu、Atul Kumar Upadhyay、Neeraj Kumar、Sugunakar Vuree
文章所属：Sumit Sheoran
摘要：前列腺癌是全球第二大危险的癌症类型。虽然存在各种治疗选择，即激动剂和拮抗剂，但它们的使用会导致不良反应，并且由于这种耐药性的发展，最终结果是缓解。因此，为了解决这个问题，我们进行了一项计算机调查，以确定 Promi独特的黄酮类候选物可用于对抗前列腺癌。该研究使用 GOLD 软件评估了 560 种天然次级多酚对抗 CDKN2 的有效性。使用蛋白质数据库检索 CDKN2 (PDB Id: 4EK3) 的 3D 晶体结构，并从 PubChem 数据库中检索选定的次级多酚的结构。化合物地奥司丁与所选蛋白质（即 CDKN2）显示出最高的 GOLD 分数，为 58.72。为了更好地理解 2 维和 3 维相互作用，使用 Discovery Studio 3.5 和 Maestro 13.5 对相互作用的氨基酸残基进行可视化。使用Schrodinger-Glide，将地奥美丁和CDKN2重新对接，并将诱饵配体与CDKN2对接，用于进一步确定研究。预测 Gold 得分最高的配体的药代动力学特征，并对结果进行制表和分析。利用 Gromacs 软件和 Desmond 软件包，100 ns 的地奥司明分子进行了分子动力学模拟来评估蛋白质-配体复合物的结构持久性和变化。此外，我们的研究表明，地奥司丁与 CDKN2 具有更好的结合亲和力（测量值为 58.72），并且在 100 ns 模拟中也表现出显着的稳定性。因此，根据临床研究，香叶草素可能会导致前列腺治疗方案。Ramaswamy H. Sarma 通讯。