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通过转录组和分子对接探索齐墩果酸治疗神经胶质瘤的潜在机制。
摘要来源：Biomed Pharmacother。 2022 年 10 月；154:113586。 Epub 2022 年 8 月 22 日。PMID：36007277
摘要作者：黄金祥、林胜男、朱峰、徐鲁宁
文章所属单位：黄金祥
摘要：目的：齐墩果酸是一种很有前景的治疗神经胶质瘤的药物，但其潜在机制尚不清楚。本研究旨在确定齐墩果酸对胶质瘤的潜在作用及其机制。
方法：首先，齐墩果酸对增殖物的作用通过MTT法、细胞克隆、流式细胞术等体外实验检测胶质瘤U251细胞的侵袭、侵袭和凋亡。对齐墩果酸处理和未处理的U251细胞的转录组数据进行mRNA测序，然后通过基因本体（GO）、基因组百科全书（KEGG）通路富集分析和蛋白质相互作用拓扑分析对差异表达基因进行分析。预测了齐墩果酸的潜在机制，并构建了相关的蛋白质相互作用网络。最后通过Western blotting和分子对接技术验证了mRNA测序结果。
结果：齐墩果酸能有效抑制增殖，集落形成、侵袭U251细胞并诱导细胞凋亡。 mRNA测序共检测到446个差异表达基因，其中96个基因上调，350个基因下调。齐墩果酸诱导细胞内水平的TNF信号通路和NOD样受体信号通路。此外，OAS2、OASL、IFIT3、RSAD2和IRF1可能是齐墩果酸治疗胶质瘤的核心靶点。
结论： 利用转录组结合分子对接技术预测齐墩果酸治疗胶质瘤的可能机制，为抗肿瘤药物的开发和研究提供新的思路和见解。